阿拉善右旗婦幼保健站擔負著全縣的婦女保健、兒童保健、婚前保健、圍產保健、托幼機構衛生保健及鄉、村級婦幼保健人員的培訓考核、工作指導等工作。科室設置合理，設有辦公室、婦保科、兒保科、婚檢科、信息宣教科、醫技科等，各科室具體功能簡介如下：婦保科：孕產婦系統管理；高危孕產婦專案管理；婦女病普查普治；孕產婦死亡上報，死因分析，漏報調查。兒保科：兒童系統管理；體弱兒專案管理；托幼機構衛生監督與指導；兒童、圍產兒死亡上報，死因分析，漏報調查。婚檢科：婚前醫學檢查；婚前教育與指導。信息宣教科：制定宣傳教育計劃；掌握有關資料和數據，以指導工作。醫技科：主要設備有大型X光機、進口B超機、紅外線乳透診斷儀、半自動生化分析儀、離心機、水浴箱、微波綜合治療儀和與保健科專業相關的必備設備。多年來阿拉善右旗婦幼保健站始終貫徹落實《中華人民共和國母嬰保健法》和《母嬰保健實施辦法》，以黨的精神為指導思想，以保健為中心，以保障生殖健康為目的，面向群體，面向基層和預防為主的方針，立足改革，謀劃發展，勇于創新，采取有效措施，全面提高了我縣婦女、兒童的健康水平。