上饒市第二人民醫院是一所集醫療、教學、科研為一體的以傳染病專科為主的綜合性醫院。醫院前身為上饒地區傳染病醫院，創建于1989年，2000年8月與江西醫學院上饒分院、上饒衛校附屬醫院合并成為具有傳染病專科優勢的集醫療、教學、科研為一體的綜合性醫院。
上饒市第二人民醫院占地111畝，總資產3400萬元，開放病床200張，設有綜合住院部、感染病住院部和綜合門診部。全院在編醫職員工215人，其中高級職稱23人，中級職稱75人；主要設備有：螺旋CT、彩超、熒光定量分析儀，全自動生化分析儀、電子胃鏡、腹腔鏡、人工肝支持系統等。上饒市第二人民醫院堅持一切以病人為中心的服務宗旨和以人為本的服務理念，從服務態度和服務條件、診療環境等方面均以人性化的服務標準進行管理和打造，不僅醫務人員服務態度好，而且住院設施齊全，住院環境整潔、優美，使病人感覺住院尤如住家，有利于病人康復。
目前設有傳染病住院部（國家定點的收治傳染病專科醫院），綜合住院部和綜合門診部，病房配有中心供氧、吸引和床頭呼叫對講系統等先進設施，尤其是新建的傳染病住院大樓每間病房配有單獨的衛生間便于患者使用。肝病科是全市重點學科，是全市各種肝病檢測、診斷、治療的權威機構。具有全市最先進的肝病診療設備和最強的肝病專家隊伍，經驗豐富、態度和藹、技術精湛，治愈了數以萬計的肝病患者，在全市乃至全省享有較高的知名度，采用各種先進的檢測系統為治療提供了科學的依據，對各種病毒性肝炎、肝硬化腹水、脂肪肝、酒精肝，各型重癥肝炎等疾病的治療科學合理，療效確切，費用低廉，深受廣大患者的好評。
急傳科對肺結核和肺外結核(腎、腸、骨關節、淋巴結核、腦膜、胸膜、腹膜、心包結核、皮膚結核等)的診斷和治療積累了豐富的經驗，尤其是對矽肺并結核、糖尿病并結核、HIV并結核、耐多藥結核(MDR-TB)、結核藥所致藥物性肝炎的處理有自己的獨到的見解。糖尿病科和中醫男科是全市重點學科，為很多糖尿病患者和男性病患者解除了疾痛。
上饒市第二人民醫院長年與上海長征醫院協作開展腹腔鏡手術，治療膽囊炎、膽石癥等效果顯著。醫院擁有各類專家20余名，配有螺旋CT、全自動生化分析儀、彩超、電子胃鏡、熒光定量PCR檢測儀、腹腔鏡、人工肝支持系統、24小時動態心電圖等先進設備.
上饒市第二人民醫院2000年是全市唯一榮獲衛生部頒發“全國衛生系統先進集體”的醫院，是市物價局樹立的“明碼標價示范單位”、“收費信得過窗口”的典型單位，2002年被評為全市“十佳醫院”。2003年被評為全省“防治‘非典’工作先進單位”等榮譽稱號。2004年被上饒市文明委評為“文明窗口”。醫院在今后的發展中，將以黨的十六大精神為指針，認真實踐“三個代表”，一如既往地堅持一切以病人為中心的服務宗旨，以人為本的服務理念，從人性化出發，不斷努力打造患者滿意的醫院。